#
# Makefile for spin routines
#

LIBS = spin
PROGS = lib$(LIBS) 
PROGLIBS=$(L)/$(SHLIB_PREFIX)$(LIBS)$(SHLIB_SUFFIX)

SRCROOT=$(SRC)/..
include $(SRCROOT)/global.mk
include ../system.mk

INCLUDES_E += $(MISC_INC) $(TK_INC)  $(TKUTILS_INC) $(SEQUTILS_INC) $(IOLIB_INC)
CFLAGS += $(SHLIB_CFLAGS)

OBJS = \
	seq_reg.o \
	seq_reg_cmds.o \
	raster_cmds.o \
	seq_raster.o \
	sequtils.o \
	seq_results.o \
	seq_sendto.o \
	spin_globals.o \
	seq_plot_funcs.o\
	seqed.o\
	tkSeqed.o \
	tkSeqedUtils.o \
	tkSeqedNames.o \
	seqed_write.o \
	seqedInterface.o\
	seqed_translate.o\
	seqed_restriction_enzymes.o\
	seqed_search.o\
	sequence_pair_display.o\
	emboss_input_funcs.o \
	readpam.o\
	compare_spans.o \
	sip_hash.o \
	sip_similar_spans.o\
	sip_find_identity.o\
	sip_quick_scan.o\
	sip_align.o \
	sip_globals.o \
	sip_cmds.o \
	sip_results.o \
	rescan_matches.o \
	probs.o \
	sim.o \
	sip_sim.o\
	init.o\
	nip_globals.o \
	nip_cmds.o \
	nip_base_comp.o \
	nip_gene_search.o \
	nip_trna_search.o\
	codon_content.o \
	nip_stop_codon.o \
	trna_search.o \
	splice_search.o \
	nip_splice_search.o \
	nip_string_search.o \
	nip_wtmatrix_search.o \
	nip_restriction_enzymes.o\
	nip_canvas_box.o\
	dinuc_freqs.o

#
# Main dependency
#
lib$(LIBS) : $(L)/$(SHLIB_PREFIX)$(LIBS)$(SHLIB_SUFFIX)
	@

DEPS = $(TK_LIB) \
       $(IOUTILS_LIB) \
       $(TKUTILS_LIB) \
       $(SEQUTILS_LIB) \
       $(MISC_LIB)


$(L)/$(SHLIB_PREFIX)$(LIBS)$(SHLIB_SUFFIX): $(OBJS) $(DEF_FILE) $(L)/.dir
	$(SHLIB_LD) $(SHLIB_LDFLAGS) $(SHLIB_OUTFLAG)$@ $(SHLIB_SONAME) $(OBJS) $(DEPS)

# 7/1/99 johnt - Rule used when $(DEF_FILE) defined - currently only for windows
$(L)/$(SHLIB_PREFIX)$(LIBS).def: $(OBJS)
	$(MKDEFL) $@ $(OBJS)


DEPEND_OBJ = $(OBJS)

distsrc: distsrc_dirs
	cp $(S)/*.[ch] $(S)/*.tcl $(S)/tclIndex $(DIRNAME)
	cp $(S)/Makefile $(S)/spin.in $(S)/spin.bat $(DIRNAME)
	cp $(S)/*.wts $(S)/niprc $(S)/siprc $(S)/spinrc $(DIRNAME)

install:
	$(INSTALL) spin $(INSTALLBIN)
	-mkdir $(INSTALLTCL)/spin
	cp $(S)/*.tcl $(S)/tclIndex $(INSTALLTCL)/spin
	cp $(PROGLIBS) $(INSTALLLIB)
	cp $(S)/*.wts $(S)/niprc $(S)/siprc $(S)/spinrc $(INSTALLETC)

# DO NOT DELETE THIS LINE -- make depend depends on it.

codon_content.o: $(PWD)/staden_config.h
codon_content.o: $(SRCROOT)/Misc/array_arith.h
codon_content.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
codon_content.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
codon_content.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
codon_content.o: $(SRCROOT)/seq_utils/dna_utils.h
codon_content.o: $(SRCROOT)/seq_utils/edge.h
codon_content.o: $(SRCROOT)/seq_utils/genetic_code.h
codon_content.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
codon_content.o: $(SRCROOT)/spin/codon_content.h
compare_spans.o: $(PWD)/staden_config.h
compare_spans.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
compare_spans.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
compare_spans.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
compare_spans.o: $(SRCROOT)/seq_utils/align.h
compare_spans.o: $(SRCROOT)/seq_utils/align_lib_old.h
compare_spans.o: $(SRCROOT)/seq_utils/dna_utils.h
compare_spans.o: $(SRCROOT)/seq_utils/edge.h
compare_spans.o: $(SRCROOT)/spin/readpam.h
compare_spans.o: $(SRCROOT)/spin/sip_hash.h
dinuc_freqs.o: $(SRCROOT)/seq_utils/dna_utils.h
emboss_input_funcs.o: $(PWD)/staden_config.h
emboss_input_funcs.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
emboss_input_funcs.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
emboss_input_funcs.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
emboss_input_funcs.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
emboss_input_funcs.o: $(SRCROOT)/spin/emboss_input_funcs.h
emboss_input_funcs.o: $(SRCROOT)/spin/seq_plot_funcs.h
emboss_input_funcs.o: $(SRCROOT)/spin/seq_raster.h
emboss_input_funcs.o: $(SRCROOT)/spin/seq_reg.h
emboss_input_funcs.o: $(SRCROOT)/spin/seq_results.h
emboss_input_funcs.o: $(SRCROOT)/spin/sequence_pair_display.h
emboss_input_funcs.o: $(SRCROOT)/spin/spin_globals.h
emboss_input_funcs.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tcl_utils.h
emboss_input_funcs.o: $(SRCROOT)/tk_utils/text_output.h
emboss_input_funcs.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkRaster.h
init.o: $(SRCROOT)/seq_utils/renz_utils.h
init.o: $(SRCROOT)/spin/nip_cmds.h
init.o: $(SRCROOT)/spin/seq_reg.h
init.o: $(SRCROOT)/spin/sequtils_cmds.h
init.o: $(SRCROOT)/spin/tkSeqed.h
init.o: $(SRCROOT)/spin/tkSeqedNames.h
init.o: $(SRCROOT)/tk_utils/intrinsic_type.h
init.o: $(SRCROOT)/tk_utils/sheet.h
init.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkRaster.h
init.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkSheet_struct.h
nip_base_comp.o: $(PWD)/staden_config.h
nip_base_comp.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
nip_base_comp.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
nip_base_comp.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
nip_base_comp.o: $(SRCROOT)/seq_utils/base_comp.h
nip_base_comp.o: $(SRCROOT)/seq_utils/dna_utils.h
nip_base_comp.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
nip_base_comp.o: $(SRCROOT)/spin/nip_base_comp.h
nip_base_comp.o: $(SRCROOT)/spin/nip_globals.h
nip_base_comp.o: $(SRCROOT)/spin/nip_raster.h
nip_base_comp.o: $(SRCROOT)/spin/nip_results.h
nip_base_comp.o: $(SRCROOT)/spin/seq_plot_funcs.h
nip_base_comp.o: $(SRCROOT)/spin/seq_raster.h
nip_base_comp.o: $(SRCROOT)/spin/seq_reg.h
nip_base_comp.o: $(SRCROOT)/spin/seq_results.h
nip_base_comp.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tcl_utils.h
nip_base_comp.o: $(SRCROOT)/tk_utils/text_output.h
nip_base_comp.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkRaster.h
nip_canvas_box.o: $(PWD)/staden_config.h
nip_canvas_box.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
nip_canvas_box.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
nip_canvas_box.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
nip_canvas_box.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
nip_canvas_box.o: $(SRCROOT)/spin/nip_results.h
nip_canvas_box.o: $(SRCROOT)/spin/seq_reg.h
nip_canvas_box.o: $(SRCROOT)/spin/seq_results.h
nip_canvas_box.o: $(SRCROOT)/tk_utils/canvas_box.h
nip_canvas_box.o: $(SRCROOT)/tk_utils/text_output.h
nip_canvas_box.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkRaster.h
nip_cmds.o: $(PWD)/staden_config.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/seq_utils/base_comp.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/seq_utils/dna_utils.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/seq_utils/edge.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/seq_utils/genetic_code.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/seq_utils/open_reading_frames.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/seq_utils/renz_utils.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/codon_content.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/dinuc_freqs.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/nip_base_comp.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/nip_canvas_box.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/nip_gene_search.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/nip_globals.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/nip_raster.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/nip_restriction_enzymes.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/nip_results.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/nip_sendto.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/nip_splice_search.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/nip_stop_codon.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/nip_string_search.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/nip_structs.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/nip_trna_search.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/nip_wtmatrix_search.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/seq_raster.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/seq_reg.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/seq_results.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/seqed.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/seqed_translate.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/seqed_write.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/sequtils.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/splice_search.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/tkSeqed.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/tkSeqedNames.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/tkSeqedUtils.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/trna_search.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/tk_utils/canvas_box.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/tk_utils/cli_arg.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/tk_utils/intrinsic_type.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/tk_utils/ruler_tick.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/tk_utils/sheet.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tcl_utils.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/tk_utils/text_output.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkRaster.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkSheet.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkSheet_common.h
nip_cmds.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkSheet_struct.h
nip_gene_search.o: $(PWD)/staden_config.h
nip_gene_search.o: $(SRCROOT)/Misc/array_arith.h
nip_gene_search.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
nip_gene_search.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
nip_gene_search.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
nip_gene_search.o: $(SRCROOT)/seq_utils/renz_utils.h
nip_gene_search.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
nip_gene_search.o: $(SRCROOT)/spin/codon_content.h
nip_gene_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_gene_search.h
nip_gene_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_globals.h
nip_gene_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_raster.h
nip_gene_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_results.h
nip_gene_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_plot_funcs.h
nip_gene_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_raster.h
nip_gene_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_reg.h
nip_gene_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_results.h
nip_gene_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tcl_utils.h
nip_gene_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/text_output.h
nip_gene_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkRaster.h
nip_globals.o: $(SRCROOT)/seq_utils/dna_utils.h
nip_globals.o: $(SRCROOT)/seq_utils/genetic_code.h
nip_globals.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
nip_globals.o: $(SRCROOT)/spin/nip_globals.h
nip_restriction_enzymes.o: $(PWD)/staden_config.h
nip_restriction_enzymes.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
nip_restriction_enzymes.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
nip_restriction_enzymes.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
nip_restriction_enzymes.o: $(SRCROOT)/seq_utils/renz_utils.h
nip_restriction_enzymes.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
nip_restriction_enzymes.o: $(SRCROOT)/spin/nip_canvas_box.h
nip_restriction_enzymes.o: $(SRCROOT)/spin/nip_globals.h
nip_restriction_enzymes.o: $(SRCROOT)/spin/nip_restriction_enzymes.h
nip_restriction_enzymes.o: $(SRCROOT)/spin/nip_results.h
nip_restriction_enzymes.o: $(SRCROOT)/spin/seq_reg.h
nip_restriction_enzymes.o: $(SRCROOT)/spin/seq_results.h
nip_restriction_enzymes.o: $(SRCROOT)/tk_utils/canvas_box.h
nip_restriction_enzymes.o: $(SRCROOT)/tk_utils/restriction_enzyme_map.h
nip_restriction_enzymes.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tcl_utils.h
nip_restriction_enzymes.o: $(SRCROOT)/tk_utils/text_output.h
nip_restriction_enzymes.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkRaster.h
nip_splice_search.o: $(PWD)/staden_config.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/seq_utils/dna_utils.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_globals.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_raster.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_results.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_splice_search.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_wtmatrix_search.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_plot_funcs.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_raster.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_reg.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_results.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/spin/splice_search.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tclXkeylist.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tcl_utils.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/text_output.h
nip_splice_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkRaster.h
nip_stop_codon.o: $(PWD)/staden_config.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/seq_utils/dna_utils.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/seq_utils/genetic_code.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/seq_utils/renz_utils.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/spin/nip_globals.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/spin/nip_raster.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/spin/nip_results.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/spin/nip_stop_codon.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/spin/seq_plot_funcs.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/spin/seq_raster.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/spin/seq_reg.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/spin/seq_results.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tclXkeylist.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tcl_utils.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/tk_utils/text_output.h
nip_stop_codon.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkRaster.h
nip_string_search.o: $(PWD)/staden_config.h
nip_string_search.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
nip_string_search.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
nip_string_search.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
nip_string_search.o: $(SRCROOT)/seq_utils/dna_utils.h
nip_string_search.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
nip_string_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_globals.h
nip_string_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_raster.h
nip_string_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_results.h
nip_string_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_string_search.h
nip_string_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_plot_funcs.h
nip_string_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_raster.h
nip_string_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_reg.h
nip_string_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_results.h
nip_string_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tclXkeylist.h
nip_string_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tcl_utils.h
nip_string_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/text_output.h
nip_string_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkRaster.h
nip_trna_search.o: $(PWD)/staden_config.h
nip_trna_search.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
nip_trna_search.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
nip_trna_search.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
nip_trna_search.o: $(SRCROOT)/seq_utils/dna_utils.h
nip_trna_search.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
nip_trna_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_globals.h
nip_trna_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_raster.h
nip_trna_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_results.h
nip_trna_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_trna_search.h
nip_trna_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_plot_funcs.h
nip_trna_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_raster.h
nip_trna_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_reg.h
nip_trna_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_results.h
nip_trna_search.o: $(SRCROOT)/spin/trna_search.h
nip_trna_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tclXkeylist.h
nip_trna_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tcl_utils.h
nip_trna_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/text_output.h
nip_trna_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkRaster.h
nip_wtmatrix_search.o: $(PWD)/staden_config.h
nip_wtmatrix_search.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
nip_wtmatrix_search.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
nip_wtmatrix_search.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
nip_wtmatrix_search.o: $(SRCROOT)/seq_utils/dna_utils.h
nip_wtmatrix_search.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
nip_wtmatrix_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_globals.h
nip_wtmatrix_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_raster.h
nip_wtmatrix_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_results.h
nip_wtmatrix_search.o: $(SRCROOT)/spin/nip_wtmatrix_search.h
nip_wtmatrix_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_plot_funcs.h
nip_wtmatrix_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_raster.h
nip_wtmatrix_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_reg.h
nip_wtmatrix_search.o: $(SRCROOT)/spin/seq_results.h
nip_wtmatrix_search.o: $(SRCROOT)/spin/splice_search.h
nip_wtmatrix_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tclXkeylist.h
nip_wtmatrix_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tcl_utils.h
nip_wtmatrix_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/text_output.h
nip_wtmatrix_search.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkRaster.h
probs.o: $(PWD)/staden_config.h
probs.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
probs.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
probs.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
probs.o: $(SRCROOT)/seq_utils/align.h
probs.o: $(SRCROOT)/seq_utils/align_lib_old.h
probs.o: $(SRCROOT)/seq_utils/dna_utils.h
probs.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
probs.o: $(SRCROOT)/spin/probs.h
probs.o: $(SRCROOT)/spin/readpam.h
probs.o: $(SRCROOT)/spin/sip_hash.h
raster_cmds.o: $(PWD)/staden_config.h
raster_cmds.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
raster_cmds.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
raster_cmds.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
raster_cmds.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
raster_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/raster_globals.h
raster_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/raster_structs.h
raster_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/seq_raster.h
raster_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/seq_reg.h
raster_cmds.o: $(SRCROOT)/spin/seq_results.h
raster_cmds.o: $(SRCROOT)/tk_utils/canvas_box.h
raster_cmds.o: $(SRCROOT)/tk_utils/cli_arg.h
raster_cmds.o: $(SRCROOT)/tk_utils/ruler_tick.h
raster_cmds.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tcl_utils.h
raster_cmds.o: $(SRCROOT)/tk_utils/text_output.h
raster_cmds.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkRaster.h
readpam.o: $(PWD)/staden_config.h
readpam.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
readpam.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
readpam.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
readpam.o: $(SRCROOT)/seq_utils/align.h
readpam.o: $(SRCROOT)/seq_utils/align_lib_old.h
readpam.o: $(SRCROOT)/seq_utils/dna_utils.h
readpam.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
readpam.o: $(SRCROOT)/spin/readpam.h
rescan_matches.o: $(PWD)/staden_config.h
rescan_matches.o: $(SRCROOT)/Misc/array.h
rescan_matches.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
rescan_matches.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
rescan_matches.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
rescan_matches.o: $(SRCROOT)/Misc/xerror.h
rescan_matches.o: $(SRCROOT)/seq_utils/align.h
rescan_matches.o: $(SRCROOT)/seq_utils/align_lib_old.h
rescan_matches.o: $(SRCROOT)/seq_utils/dna_utils.h
rescan_matches.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
rescan_matches.o: $(SRCROOT)/spin/readpam.h
rescan_matches.o: $(SRCROOT)/spin/seq_raster.h
rescan_matches.o: $(SRCROOT)/spin/seq_reg.h
rescan_matches.o: $(SRCROOT)/spin/seq_results.h
rescan_matches.o: $(SRCROOT)/spin/sip_results.h
rescan_matches.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkRaster.h
seq_plot_funcs.o: $(PWD)/staden_config.h
seq_plot_funcs.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
seq_plot_funcs.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
seq_plot_funcs.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
seq_plot_funcs.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
seq_plot_funcs.o: $(SRCROOT)/spin/seq_raster.h
seq_plot_funcs.o: $(SRCROOT)/spin/seq_reg.h
seq_plot_funcs.o: $(SRCROOT)/spin/seq_results.h
seq_plot_funcs.o: $(SRCROOT)/tk_utils/text_output.h
seq_plot_funcs.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkRaster.h
seq_raster.o: $(PWD)/staden_config.h
seq_raster.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
seq_raster.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
seq_raster.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
seq_raster.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
seq_raster.o: $(SRCROOT)/spin/seq_raster.h
seq_raster.o: $(SRCROOT)/spin/seq_reg.h
seq_raster.o: $(SRCROOT)/spin/seq_results.h
seq_raster.o: $(SRCROOT)/spin/spin_globals.h
seq_raster.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tcl_utils.h
seq_raster.o: $(SRCROOT)/tk_utils/text_output.h
seq_raster.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkRaster.h
seq_reg.o: $(PWD)/staden_config.h
seq_reg.o: $(SRCROOT)/Misc/array.h
seq_reg.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
seq_reg.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
seq_reg.o: $(SRCROOT)/Misc/xalloc.h
seq_reg.o: $(SRCROOT)/Misc/xerror.h
seq_reg.o: $(SRCROOT)/seq_utils/sequence_formats.h
seq_reg.o: $(SRCROOT)/spin/seq_raster.h
seq_reg.o: $(SRCROOT)/spin/seq_reg.h
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sip_similar_spans.o: $(SRCROOT)/spin/readpam.h
sip_similar_spans.o: $(SRCROOT)/spin/rescan_matches.h
sip_similar_spans.o: $(SRCROOT)/spin/seq_plot_funcs.h
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splice_search.o: $(PWD)/staden_config.h
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tkSeqed.o: $(SRCROOT)/Misc/os.h
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tkSeqed.o: $(SRCROOT)/seq_utils/renz_utils.h
tkSeqed.o: $(SRCROOT)/spin/seq_reg.h
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tkSeqed.o: $(SRCROOT)/spin/seqed_restriction_enzymes.h
tkSeqed.o: $(SRCROOT)/spin/seqed_search.h
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tkSeqedNames.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkSheet_struct.h
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tkSeqedUtils.o: $(SRCROOT)/tk_utils/intrinsic_type.h
tkSeqedUtils.o: $(SRCROOT)/tk_utils/sheet.h
tkSeqedUtils.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkRaster.h
tkSeqedUtils.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkSheet.h
tkSeqedUtils.o: $(SRCROOT)/tk_utils/tkSheet_common.h
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trna_search.o: $(PWD)/staden_config.h
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trna_search.o: $(SRCROOT)/Misc/misc.h
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trna_search.o: $(SRCROOT)/seq_utils/genetic_code.h
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trna_search.o: $(SRCROOT)/spin/trna_search.h
